2025 год. События «Мастерфорс» канули в лету. Отряды автоботов, возглавляемые мощным трансформером Стар Сейбер, охраняют Землю от Десзараса и его десептиконов.
Десзарас жаждет вычерпать энергетические ресурсы планеты, возродить гигантскую боевую станцию «Космическая крепость» и покорить Вселенную. Для этого его верные подчинённые – Леозак, Дриллхорн, брестфорсы, боевые динозавры и прочие десептиконы – ищут энергию в различных населённых пунктах.
Несмотря на героическое сопротивление автоботов, войско Десзараса добирается до легендарной Атлантиды, богатой различными ресурсами, возрождает космическую крепость и обрушивает на голубую планету метеоритную бомбардировку. Казалось бы, всё пропало, но секрет энергоснабжения вражеской станции неожиданно раскрывает Чжан – мальчишка, выросший в полку автоботов…